Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm12888Q3UW77 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms