Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms