Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf224Q3UIW8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms