Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U595 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms