Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tbc1d2bQ3U0J8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms