Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem88bQ3TYP4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms