Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms