Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms