Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna5Q2MKA5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms