Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
1700061G19RikQ08EE8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms