Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms