Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms