Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms