Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms