Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms