Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms