Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms