Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp25P57080 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms