Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms