Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dbx1P52950 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dbx1P52950 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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