Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FmodP50608 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FmodP50608 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms