Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ItgavP43406 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms