Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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