Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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