Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RarbP22605 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RarbP22605 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RarbP22605 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RarbP22605 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RarbP22605 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RarbP22605 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RarbP22605 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RarbP22605 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RarbP22605 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RarbP22605 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms