Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb9P20615 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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