Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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