Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01789 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01789 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01789 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
P01789 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01789 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms