Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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