Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcof1O08784 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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