Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms