Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6594J3QM43 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms