Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms