Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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H2-M1F7CXU4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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