Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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