Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms