Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fndc1E9Q043 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms