Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc8E9PWG2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms