Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Clip3B9EHT4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms