Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms