Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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