Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm14862B1AV28 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms