Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik3B1AS29 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms