Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprsB0V2N1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms