Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp4A4UUI3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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