Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Rtf1A2AQ19 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Rtf1A2AQ19 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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