Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms