Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ambra1A2AH22 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms