Protein–RNA interactions for Protein: S4R185

Gm26938, Predicted gene, 26938 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26938S4R185 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm26938S4R185 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms