Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Robo3Q9Z2I4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms